La regolazione del genoma è oggi un argomento centrale della Biologia Molecolare. I meccanismi di controllo epigenetico, insieme alle reti regolatorie trascrizionali e post-trascrizionali, sono elementi chiave per la comprensione dei principali aspetti della biologia cellulare nella fisiologia normale e patologica.
L'attività dei geni è controllata principalmente a livello della cromatina, mediante la costituzione di regioni genomiche accessibili ai fattori trascrizionali e regioni inaccessibili. I fattori trascrizionali, interagiscono con sequenze regolatorie (promotori ed enhancers) guidando la trascrizione dell'RNA che interagirà con un'ampia varietà di proteine in grado di, determinare quali parti dei trascritti dovranno essere rimosse (splicing alternativo) e dove verrà aggiunta la coda di poliadenilazione.
Una volta esportati nel citoplasma, gli RNA sono ulteriormente sottoposti a controlli di compartimentalizzazione cellulare, traduzione e degradazione mediante diversi meccanismi ed effettori tra i quali i microRNA. La profondità di sequenziamento e il costo decrescente delle tecnologie di sequenziamento hanno permesso di dimostrare che la maggior parte del genoma viene effettivamente trascritta, dando origine a una costellazione di RNA non codificanti, tra cui anche molecole di RNA circolari prodotte dal back-splicing degli esoni. Il "trascrittoma" è oggi attivamente studiato anche per un possibile coinvolgimento nella biomedicina traslazionale.
Il nostro gruppo è interessato ai meccanismi di regolazione del genoma sia a livello epigenetico, trascrizionale che post-trascrizionale con focus principale sul cancro. Lo studio dell’alterazione dell’espressione genica in seguito a cambiamenti epigenetici nelle regioni regolatorie genomiche e della rete regolatoria coinvolta nella progressione tumorale può aprire la strada verso l'identificazione di potenziali bersagli terapeutici. D'altra parte, particolari profili di espressione dell'RNA sono usati come "proxy" di specifici  fenotipi di cancro e possono essere usati per la diagnosi, la prognosi e la previsione della risposta ai trattamenti medici.
Il nostro gruppo applica tecniche di biologia molecolare e cellulare con approcci di biologia computazionale e dei sistemi complessi per studiare l'espressione aberrante dell'RNA e la sua dipendenza dalla regolazione genomica.