RNA circolari come biomarcatori precoci del carcinoma polmonare: un approccio di biopsia liquida
CircRNAs as early biomarkers of lung cancers: a liquid-biopsy approach
Aree / Gruppi di ricerca
Partecipanti al progetto
Descrizione del progetto
Lung cancer is a major big-killer tumor and radical surgery remains the only curative option. However, recurrences are frequent and strict follow-up is required. The identification of reliable early biomarkers is an urgent need. Circular RNAs (circRNAs) are covalently closed RNA structures with several functions in cancer development. Recently, cancer-specific and tissue-specific circRNAs have been identified by high-throughput sequencing and are curated in publicly available databases. CircRNAs showed ideal features of biomarkers including conservation, abundance, and stability in biofluids. The aim of the project is the identification of circRNAs as non-invasive biomarkers for early detection of lung cancer recurrence by the development of integrated approaches based on bioinformatics analysis, functional validation assays, and detection of low abundance RNA species by digital PCR in plasma samples.
Il cancro del polmone è un noto tumore big-killer e la chirurgia radicale rimane l'unica opzione curativa. Tuttavia, le recidive sono frequenti ed è necessario un follow-up rigoroso. L'identificazione di biomarcatori precoci affidabili è un impellente necessità. Gli RNA circolari (circRNA) sono trascritti con estremità chiuse da legame covalente con diverse funzioni nello sviluppo del cancro. Mediante tecnologia NGS ad alta profondità è stato possibile identificare specifici circRNA tumorali attualmente annotati in database disponibili pubblicamente. I CircRNA mostrano caratteristiche di biomarcatori ideali, tra cui conservazione tra le specie, abbondanza, e stabilità nei biofluidi. Lo scopo del progetto è l'identificazione dei circRNA come biomarcatori non invasivi per la diagnosi precoce delle recidive del cancro al polmone mediante lo sviluppo di approcci integrati basati sull'analisi bioinformatica, saggi di validazione funzionale e rilevazione quantitativa di specie di circRNA mediante PCR digitale in campioni di plasma.